Kości: 11x2

The Brother in the Basement

24 godziny przed poprzednim odcinkiem widzimy Bootha i kilku ludzi jak podpalają samochód z ciałem Jareda. Tymczasem FBI za przyczyną agentki Miller zaczyna podejrzewać Seeleya o przestępstwo i ucieczkę. Oczywiście, nie wierzy w to ekipa z Jeffersonian. Ranny w brzuch Booth jest z ludźmi, którzy chcą dokonać wymiany listy agentów na 2 miliony dolarów. Okazuje się, że partner agentki Miller jest w to zamieszany, porwano jego dziewczynę i szantażowano go, by zdobył informacje o danych innych agentów. Booth i Jared chcieli temu zapobiec. Po śledztwie Aubreya odnajdują się kolejne ciała, w tym partnera Miller, sytuacja się wyjaśnia. W końcu FBI dociera do walczącego o życie Bootha. Seeley jest uratowany. Brennan postanawia wrócić do pracy w Instytucie Jeffersonian, bo okazało się, że bez jej obecności jest gorzej postrzegany. Booth oficjalnie wraca do FBI. Arastoo w związku z powrotem Bones szuka innego miejsca pracy, ma zamiar wyjechać do Dubaju. W związku z tym, że Cam nie opuści instytutu, para rozstaje się.